Впр предмет: что такое ВПР на семейном образовании, как подготовить к ним ребёнка

Была создана неофициальная рабочая группа для продолжения разработки и тестирования предлагаемой методологии (в общей сложности 17 Сторон назначили экспертов). Вводное совещание Рабочей группы было проведено в Тбилиси, Грузия, с 11 по 13 февраля 2015 года. На совещании обсуждалась методология, представленная двенадцатому совещанию Конференции Сторон, и были разработаны пересмотренная методология и план работы. Было также решено, что пересмотренная методология должна быть опробована как минимум в двух странах. Эфиопия и Индия были выбраны в качестве стран для тестирования, что дает хороший географический и социально-экономический диапазон (кроме того, обе страны недавно пересмотрели свои НСПДСБ).Второе совещание неофициальной рабочей группы было созвано в Берне, Швейцария, с 16 по 18 марта 2016 года для рассмотрения двух опытов тестирования и дальнейшей разработки методологии.

(a) Оценить разработку и осуществление национальных стратегий и планов действий по сохранению биоразнообразия (НСПДСБ) в контексте Стратегического плана в области сохранения и устойчивого использования биоразнообразия на 2011-2020 годы и подготовить конкретные рекомендации для рассматриваемых Сторон;

(b) предоставить возможности для взаимного обучения непосредственно вовлеченным Сторонам и другим Сторонам;

(c) Обеспечить большую прозрачность и подотчетность при разработке и реализации НСПДСБ перед общественностью и другими Сторонами.

VPR Обновление COVID-19 — 27 мая 2021 г. — вице-президент по исследованиям

8 июня 2021 г.

Уважаемые коллеги,

Спасибо всем за посещение Ратуши виртуальных исследований 24 мая, ^, . Мы надеемся, что ратуши VPR были информативными в общении с исследовательским кампусом. обновления, а также полезны для связи друг с другом во время этих сложных раз.Мы искренне ценим ваши отзывы и участие в этих мероприятиях мэрии.

Вот обновления VPR COVID-19:

• Запись Virtual Research Town Hall теперь доступна на U Box
• Обновлено руководство по маскам для лица в Университете здравоохранения штата Юта
  U of U Health обновило руководство по использованию масок для лица в Университете здравоохранения штата Юта — в том числе в специализированных, многофункциональных и неклинических учреждениях (см. Приложение).Вы можете получить доступ к самой последней версии на Pulse.
• COVID-19 Руководство по поездкам в университет
  Напоминаем, что в настоящее время Университет ограничивает все входящие и исходящие бизнесы. до 30 июня 2021 г. Начиная с 1 июля ограничения на поездки внутри страны будут конец. Международные поездки подлежат процедурам утверждения. Посетите веб-сайт финансовых и бизнес-услуг для получения более подробной информации.

Еще раз благодарим вас за терпение, пока мы продолжаем просматривать эти обновления. и изменения. Пожалуйста, дайте нам знать, если у вас есть какие-либо вопросы. Мы с нетерпением ждем встречи все вы скоро.

С уважением,

Энди Вейрих, вице-президент по исследованиям
Дайан Патаки, заместитель вице-президента по исследованиям
Эрин Ротвелл, заместитель вице-президента по вопросам целостности исследований и соблюдения нормативных требований

изменений в С-концевой области дополнительного гена ВИЧ-1 vpr не дают клинических преимуществ субъектам, получающим нуклеозидную антиретровирусную терапию | Журнал инфекционных болезней

Аннотация

С-конец дополнительного белка вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) vpr действует в остановке вирусного клеточного цикла, ядерной локализации и апоптоза.Полиморфизмы в этой области описаны в ряде случаев длительного отсутствия прогрессирования. Мы определили vpr последовательностей заархивированных исходных образцов от 96 участников исторического испытания ингибиторов обратной транскриптазы с одним и двумя нуклеозидами. Затем эти последовательности анализировали по характеристикам начала исследования и результатов, таким как исходное абсолютное количество клеток CD4 ⁺ , предшествующее лечение, ответ клеток CD4 ⁺ и клинические конечные точки. Частота C-концевых мутаций не коррелировала с какими-либо показателями интенсивности заболевания.Изменения в этой части vpr не ослабляли болезнь.

Среди потенциальных вирусных детерминант клинического заболевания ВИЧ-1, дивергенция последовательностей в дополнительных белковых областях, а также в env и gag может влиять на прогрессирование заболевания [1–3]; например, изменения в HIV-1 nef предрасполагают к долгосрочному непрогрессированию (LTNP) [4, 5]. Отклонения от согласованной последовательности в других генах вспомогательного белка ВИЧ-1 были предложены в качестве дополнительных факторов, ослабляющих болезнь [1, 6].Vpr, один из 6 дополнительных белков ВИЧ, достаточно консервативен in vivo по сравнению с большинством лентивирусных белков. Хотя его роль в инфицировании ВИЧ-1 остается несколько неясной, in vitro он выполняет множество функций. Vpr останавливает клеточный рост в фазе G2 клеточного цикла, тем самым усиливая трансактивацию с помощью длинно-концевого повтора ВИЧ, и содержит сигналы ядерного импорта, которые способствуют захвату преинтеграционного комплекса ВИЧ [7]. Vpr также способствует нарушению трансмембранного потенциала митохондрий и активации цитохром с-зависимой каспазы [7–9].

Некоторые функции vpr, а именно, его апоптоз, ядерная локализация и способность останавливать клетки, картируются на его С-конце [8-11]. Мутационный анализ выявил область, охватывающую аминокислотные остатки 71–96, которые охватывают 2 жестко консервативных полипептидных мотива HFRIG, охватывающих обратный поворот β [10]. Недавнее сообщение продемонстрировало, что при применении к культурам лимфоцитарных клеток, мутант пептида vpr ВИЧ-1, псевдотипированного вирусом везикулярного стоматита по кодону 77, индуцирует меньший апоптоз, чем vpr дикого типа [9].Вирусные последовательности LTNPs содержат мутационные изменения в этой относительно консервативной области генома ВИЧ-1 [9, 12-14]; например, четыре пятых последовательностей vpr из 10 LTNP демонстрируют полиморфизм в кодоне 77 vpr , по сравнению с гораздо меньшим процентом в последовательностях из 15 не-LTNP [9]. Соответственно, мы исследовали, соответствует ли отклонение от консенсусных последовательностей C-конца клады B vpr ослабленному прогрессированию заболевания у участников клинических испытаний ВИЧ-1, получавших лечение до появления мощной антиретровирусной терапии.

Предметы, материалы и методы.

Субъекты, материалы и методы . Сто три ВИЧ-1-инфицированных субъекта без СПИДа, включенных в наш центр в течение 1991–92 гг. В большом многоцентровом слепом исследовании однократного обратного двойного нуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы ( НИОТ) антиретровирусная терапия (протокол 175 Группы клинических исследований СПИДа) [15]. Информированное согласие было получено от пациентов, и были соблюдены руководящие принципы экспериментов на людях Министерства здравоохранения и социальных служб США.Для включения в исследование национальное родительское исследование требовало, чтобы субъект имел нормальный функциональный статус и исходное абсолютное количество Т-лимфоцитов CD4 ⁺ 200–500 клеток / мм ³ . Аликвоту базового уровня перед включением криоконсервированных мононуклеарных клеток периферической крови (PBMC), способных давать информацию о последовательности, получали от каждого из 96 субъектов в нашем центре. Данные об истории болезни, конечной точке и серийном абсолютном количестве CD4 ⁺ Т-лимфоцитов за 2 года были получены из базы данных исходного исследования [15].

Тотальную ДНК экстрагировали на спин-колонке (QIAamp DNA Mini kit; Qiagen) из криоконсервированных гранул первичных РВМС, а затем амплифицировали в объеме с помощью вложенной полимеразной цепной реакции (внешние праймеры NL4-3-552IF [5′-CCACCTTTGC-CTAGTGTTAG -3 ‘] и 5891R [5′-GCAGTTTTAGGCTGACT-TCC-3′], внутренние праймеры NL4-3-555 IF [5’-GAGG AC AG AT-GGAACAAGCC-3 ‘] и 5858R [5’-GGCTCTAGTCTAGGAT-CTAC- 3 ‘]) для области, кодирующей ВИЧ-1 vpr , кодоны 5–96.

Продукты очищали гель-электрофорезом и спин-колонкой (QIAquick gel kit; Qiagen), секвенировали дидезоксинуклеотидный цикл на ABI 377 и для анализа выравнивали с помощью программного обеспечения Sequencher с консенсусной последовательностью клады B.Клинические данные были получены после регистрации всех лабораторных результатов. Статистический анализ ассоциации по клиническим исходам полиморфизмов С-концевой последовательности vpr с использованием критерия Стьюдента t .

Результаты

Результаты. Современная эффективная комбинированная антиретровирусная терапия по стандарту лечения может маскировать преимущества, которые имеют ключевые мутации vpr на С-конце для клинического течения. По этой причине мы стремились ретроспективно оценить образцы и клинические данные из более раннего исследования.Протокол 175 ACTG был самой ранней доступной нам большой когортой с периода, предшествующего терапии тройными антиретровирусными комбинациями. Таким образом, он обладал преимуществом ограниченного воздействия лекарственного средства на исходном уровне. В этом многоцентровом исследовании 82% из почти 2500 участников были мужчинами, средний возраст которых составлял 35 лет. Среднее абсолютное количество CD4 ⁺ Т-клеток среди участников нашего сайта составило 331 клетка / мм ³ (диапазон: 186–533 клеток / мм ³ ; медиана 304 клеток / мм ³ ), что аналогично среднему значению. 352 клеток / мм ³ в национальном исследовании.Хотя люди с предшествующими заболеваниями, определяющими СПИД, не соответствовали критериям отбора, примерно у одной пятой испытуемых наблюдались состояния, связанные с ВИЧ, такие как кандидоз кожно-слизистых оболочек, опоясывающий лишай и / или конституциональные симптомы. В нашем исследовании 72% субъектов ранее получали монотерапию зидовудином, тогда как 43% участников исследования ACTG 175 не получали антиретровирусную терапию. За исключением этой разницы, наша подгруппа хорошо представляла базовые демографические данные национального исследования.

В соответствии с результатами, описанными в литературе, 2 полипептидных мотива HSRIG в кодонах 71–75 и 78–82 С-концевой области vpr были строго консервативными.Точно так же цистеин в кодоне 76 и изолейцин в кодоне 83 почти всегда присутствовали. Нуклеотиды в це-спиральном домене выше кодона 70 также хорошо консервативны. Напротив, значительный полиморфизм без доминантного паттерна наблюдался в кодонах 84–86 и кодоне 89. Наиболее важно то, что консенсусный аргинин подтипа B в кодоне 77 был заменен глутамином в 38 (40%) из 96 последовательностей. Эта частота замены R77Q аналогична частоте, обнаруженной в подсчете почти 300 последовательностей подтипа B vpr , зарегистрированных в базе данных Лос-Аламоса до 2002 года.

С-концевые последовательности Vpr не коррелировали с тяжестью предшествующего клинического заболевания. Чтобы определить, может ли замена R77Q или полиморфизм ниже второго мотива HSRIG коррелировать с маркерами ранее существовавшего медленно прогрессирующего заболевания, мы сравнили частоту конкретных изменений С-концевой аминокислоты vpr с исходными абсолютными CD4 ⁺ Т-клетками. подсчитывается и с получением либо профилактики пневмонии Pneumocystis carinii, (PCP), либо монотерапии зидовудином до включения в исследование.Никакая замена в кодонах 84–89 не была достаточно распространенной, чтобы оправдать сортировку по клиническому исходу. Абсолютное количество CD4 ⁺ Т-клеток при регистрации не коррелировало с наличием мутации глутамина в кодоне 77 и, фактически, противоречило нашей гипотезе. Например, 46% последовательностей от субъектов с исходным абсолютным количеством CD4 ⁺ Т-лимфоцитов ниже медианы, 304 клеток / мм ³ , содержали замену R77Q, тогда как это произошло только в 33% последовательностей от субъектов с CD4 ^* Т-лимфоцитов выше медианы (таблица 1).Аналогичным образом, когда предыдущее лечение рассматривалось как маркер более запущенного и, следовательно, потенциально более интенсивного ранее существовавшего заболевания, 60% субъектов, получавших профилактику PCP, и 41% тех, кто получал монотерапию зидовудином, имели замену R77Q по сравнению с 33% и 37%, соответственно, из тех, кто ранее не лечился (P> 0,25) (таблица 1).

Таблица 1.

Наличие vpr С-концевой замены R77Q в подтипе B, исходные изоляты ВИЧ-1, полученные от исследуемых субъектов, по маркерам клинического статуса и прогрессирования.

Таблица 1.

Наличие vpr С-концевой замены R77Q в подтипе B, исходные изоляты ВИЧ-1, полученные от исследуемых субъектов, по маркерам клинического статуса и прогрессирования.

Мутации на С-конце vpr при включении в исследование также заметно не ослабляли прогрессирование заболевания в ходе исследования. Ни изменение абсолютного количества Т-лимфоцитов CD4 ⁺ , ни наклон абсолютного количества Т-лимфоцитов CD4 ⁺ за все временные точки исследования не повлияли на изменения в последовательности С-концевой области vpr .В частности, 14 (41%) из 34 субъектов с положительным наклоном абсолютного количества CD4 ⁺ Т-клеток и 23 (37%) из 62 человек с отрицательным наклоном имели изменение последовательности в кодоне 77 (таблица 1). Кроме того, с 0 по 128 неделю исходная мутация присутствовала у 44% тех, у кого впоследствии было положительное изменение абсолютного количества CD4 ⁺ Т-лимфоцитов, и у 36% тех, у кого впоследствии было отрицательное изменение абсолютного количества CD4 ⁺ Т-лимфоцитов, статистически незначимая разница (таблица 1).К сожалению, исследование ACTG 175 было начато до того, как тестирование на вирусную нагрузку плазмы стало обычным явлением, поэтому количественный вирусологический результат не мог быть оценен. В нашем исследовании 28 из 96 субъектов имели клиническую конечную точку, состоящую из СПИД-определяющего или связанного с ВИЧ заболевания или истощения. Из этих 28 человек изоляты из 13 содержали замену R77Q в последовательности vpr , тогда как 25 (37%) из 68 субъектов, не имевших таких конечных точек, содержали ее (таблица 1). Опять же, это статически незначимое (P> .25) тенденция противоречила тому, что можно было бы ожидать, если бы изменение кодона 77 было защитным. Эти протокольные результаты не изменились, когда анализ был стратифицирован по назначению исследуемого препарата.

Обсуждение

Обсуждение . Вариация последовательности участков генома ВИЧ pol, env, gag и nef влияет на клиническое течение заболевания; оценки LTNPs показали C-концевые мутации в дополнительном дополнительном белке, vpr [8, 9, 12–14].В частности, обзор Lum et al. Последовательностей vpr из LTNP, содержащихся в базе данных Лос-Аламоса, показал, что 7% из них демонстрируют полиморфизм в кодоне 77 из vpr по сравнению с 36% таких последовательностей из не-LTNP [9 ]. Такие наблюдения, наряду с предполагаемыми исследованиями in vitro, породили нашу гипотезу о том, что изменения в этой обычно высококонсервативной части генома ВИЧ-1 могут быть связаны с более медленным прогрессированием ВИЧ. В нашей минимально предварительно обработанной группе прогрессоров заболевания ВИЧ-1 объемное секвенирование из архивированных PBMCs показало в 40% образцов изменение согласованной последовательности в кодоне 77 в пределах C-конца vpr. Этот процент намного ниже, чем тот, который ранее был обнаружен в LTNP, но отражает этот процент в последовательностях подтипа B vpr в базе данных Лос-Аламоса.

У наших хорошо охарактеризованных субъектов при регистрации было доступно несколько маркеров, позволяющих различать более продвинутые и менее продвинутые стадии клинического заболевания ВИЧ-1. Однако не было корреляции между интенсивностью предшествующего заболевания, выявленной этими маркерами, и С-концевыми последовательностями vpr субъектов.К сожалению, у нас нет данных о дате заражения ВИЧ-1 у субъектов и, следовательно, о продолжительности их инфицирования до включения в исследование. Конечно, предшествующая профилактика PCP или монотерапия зидовудином или абсолютное количество Т-лимфоцитов CD4 ⁺ ниже медианы в исследовании могут частично отражать более длительную продолжительность инфекции; следовательно, наше предположение о том, что эти маркеры исходного статуса отражают либо более вирулентную инфекцию, либо более быстрое прогрессирование заболевания до включения в исследование, необходимо смягчить.Тем не менее, наше предположение может быть в значительной степени справедливым, потому что большинство людей с ВИЧ-1, которые жили в нашем штате на момент проведения нашего исследования, вероятно, были инфицированы в течение ограниченного периода времени в середине 1980-х годов.

Единственное сомнение в том, что наши испытуемые не были полностью терапевтически наивными. В группе ACTG 175 их лечили 1 или 2 нуклеозидными ингибиторами обратной транскриптазы — либо зидовудином, либо диданозином, либо зидовудином в сочетании с диданозином или залцитабином [15].Однако, учитывая, что три четверти из них ранее получали монотерапию зидовудином, по сегодняшним стандартам это были явно минимальные схемы. Таким образом, вызывает разочарование тот факт, что ожидаемая польза от С-концевых мутаций vpr не нашла отражения в маркерах ответа исследования.

Эти результаты предполагают, что ослабляющий болезнь эффект мутации на С-конце vpr , в частности обогащенная замена R77Q, наблюдаемая в большинстве случаев LTNP подтипа B ВИЧ, опубликованных на сегодняшний день, не влияет на течение ВИЧ-инфекции. .Для объяснения этого очевидного противоречия можно привести несколько соображений. Во-первых, возможно, что механизмы R77Q, управляющие ослаблением болезни, также зависят от хозяина, и что мишени-хозяева, с которыми взаимодействует мутант vpr , каким-то образом уникальны для LTNP. Кроме того, наши субъекты участвовали в одном из первых североамериканских испытаний комбинированной антиретровирусной терапии [15], и поэтому наше исследование могло быть смещено в сторону включения субъектов с более агрессивными траекториями болезни.Это возможное «смещение когортной прогрессии» могло затмить относительно слабый эффект против . Наконец, мы выполнили определение последовательности на ампликонах из цельной вирусной ДНК

PBMC. Ограниченные данные предполагают, что квазивиды ВИЧ-1 в С-концевой области vpr могут существовать у одного человека [12]. Если это возможно, то можно ожидать, что наш метод будет недооценивать квазивиды с вариантами меньшинства и склонит наш анализ к обнаружению большего количества вирусов дикого типа.В дополнение к этим ограничениям уместно, что самое крупное опубликованное сравнение последовательностей LTNP и прогрессирующего ВИЧ-1 было получено из базы данных Лос-Аламоса [9], подход, вероятно, искаженный потенциальной систематической ошибкой в ​​собранных последовательностях. Интересно, что консенсусный кодон 77 дикого типа для ВИЧ-1 подтипа C vpr в настоящее время указан как R77Q. По этим причинам мы полагаем, что окончательные ответы относительно клинического значения или отсутствия замены R77Q на С-конце vpr как у LTNP, так и у других инфицированных лиц, требуют дополнительных исследований.

В заключение, хотя данные in vitro свидетельствуют о том, что критические детерминанты апоптоза и остановки клеточного цикла лежат в пределах С-конца vpr, изменения в этой области, очевидно, не повлияли на клинические исходы у пациентов, получавших нуклеозиды в нашем исследовании. По-прежнему может быть, что полиморфизмы vpr, возможно, в сочетании с другими, еще не изученными геномными вариациями ВИЧ-1 или хозяина, действительно играют роль в сохранении статуса LTNP. Тем не менее, дополнительный анализ когорт LTNP и механизмов in vitro должен предшествовать как дальнейшему исследованию образцов из репозиториев естественного происхождения ВИЧ-1, так и началу проспективного испытания на прогрессирующих пациентах, не получавших терапию.

Благодарности

Мы благодарим Джилл Гисбрехт и Мэг Лелонек за помощь в лаборатории и Лилиан Саркинен за подготовку рукописи.

Список литературы

Сравнение провирусных дополнительных генов у длительно непрогрессоров и прогрессоров инфекции вируса иммунодефицита человека типа 1

Arch Virol

2000

145

1021

1027

Характеристика последовательностей gag и pol от длительно переживших инфекцию вируса иммунодефицита человека типа 1

Virology

1998

240

36

49

Необычный полиморфизм вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированный с непрогрессирующей инфекцией

J Virol

2000

74

4361

4376

Анализ вирусных аллелей nef у женщин с непрогрессирующей или медленно прогрессирующей инфекцией ВИЧ-1 [аннотация 88]. Восьмая конференция по ретровирусам и оппортунистическим инфекциям, Чикаго

февраль 2001 г.

Иммунологический и вирусологический статус после 14–18 лет инфицирования аттенуированным штаммом ВИЧ-1: отчет группы Sidney Blood Bank Cohort

N Engl J Med

1999

340

1715

1722

Выделение гена человека, который ингибирует инфекцию ВИЧ-1 и подавляется вирусным белком Vif

Nature

2002

418

646

650

Изучение биологии вирусного белка ВИЧ-1 R

и клеточной биологии

2002

21

679

688

Митохондриотоксический домен vpr определяет вирулентность ВИЧ-1

J Clin Invest

2003

111

1455

1457

Vpr R77Q связан с длительной непрогрессирующей ВИЧ-инфекцией и нарушением индукции апоптоза

J Clin Invest

2003

111

1547

1554

Остатки в последовательности HFRIGC ВИЧ-1 vpr , участвующие в активности остановки роста

Biochem Biophys Res Commun

1999

264

287

290

Остатки аргинина на С-конце ВИЧ-1 vpr важны для ядерной локализации и остановки клеточного цикла

Virology

1998

242

414

424

Генные дефекты, сгруппированные на C-конце гена vpr ВИЧ-1 в длительно не прогрессирующей паре мать и ребенок: эволюция квазивидов vpr in vivo в крови и плазме крови и плазмы

Virology

1996

223

224

232

Дефектные вспомогательные гены у долгосрочного выжившего, инфицированного вирусом иммунодефицита человека типа 1, без излечимого вируса

J Virol

1995

69

4228

36

Грубые дефекты генов vpr и vpu ВИЧ типа 1 не могут объяснить различия в количестве копий РНК между длительно бессимптомными и прогрессирующими пациентами

AIDS Res Hum Retroviruses

1997

13

247

52

Испытание по сравнению монотерапии нуклеозидами с комбинированной терапией у ВИЧ-инфицированных взрослых с числом клеток CD4 от 200 до 500 на кубический миллиметр

N Engl J Med

1996

335

1081

90

© 2004 Американское общество инфекционных болезней

границ | Освещение роли Vpr в ВИЧ-инфекции миелоидных клеток

Введение

Передача половым путем — это преобладающий способ заражения ВИЧ («Global AIDS Update», 2016 г.).В то время как точный тип клеток, нацеленных на ВИЧ в слизистой оболочке половых органов, остается предметом споров (1–3), различные подмножества дендритных клеток (ДК) и макрофагов присутствуют в высоких концентрациях в слизистой оболочке половых органов и, следовательно, могут быть ранними мишенями для заражения. ВИЧ (4–6). Заражение ДК и макрофагами особенно важно, поскольку они обладают уникальной способностью передавать ВИЧ с высокой эффективностью к CD4 + Т-клеткам во время презентации антигена во вторичных лимфоидных органах (5, 7, 8). Как профессиональные антигенпрезентирующие клетки, ДК и макрофаги имеют уникальную клеточную архитектуру, позволяющую инициировать и поддерживать устойчивые взаимодействия с CD4 + Т-клетками.Формирование вирусологического синапса между DC / макрофагами и CD4 + T-клетками обеспечивает направленную доставку ВИЧ к его наиболее благоприятному хозяину: активированным CD4 + T-клеткам (9). Для передачи через слизистые оболочки и создания продуктивной инфекции ВИЧ должен преодолевать не только тканевые барьеры (3), но и ряд присущих клеткам иммунных защитных механизмов или факторов ограничения, таких как APOBEC3G (цитидиндезаминаза, которая резко увеличивает количество мутаций генома. ), тетерин (который предотвращает образование почки вируса ВИЧ и усиливает положительную петлю IFN типа I при подавлении образования вируса) и SAMHD1 (dNTPase, которая ограничивает уровни dNTP в цитоплазме, чтобы препятствовать обратной транскрипции), которые предотвращают лентивирусную инфекцию DC приматов, макрофаги и покоящиеся Т-клетки (10–13).Однако лентивирусы приматов эволюционировали, чтобы противодействовать этим факторам рестрикции, кодируя вспомогательные белки, которые избирательно ингибируют их противовирусную функцию. Хотя предполагается, что он действует в этом качестве, функция Vpr еще предстоит полностью понять.

Vpr, или вирусный белок R, представляет собой белок 14 кДа, кодируемый всеми существующими лентивирусами приматов. Vpr активно упаковывается в вирионы благодаря взаимодействию с областью p ⁶ Gag (14, 15) и, как таковой, играет роль как на пре-, так и на постинтеграционных стадиях жизненного цикла вируса.Первоначально описанный как вспомогательный белок и, следовательно, незаменимый для репликации вируса in vitro , с тех пор было показано, что он играет важную роль в инфицировании макрофагов и дендритных клеток (16-19). Важно отметить, что функция Vpr необходима для вирусного патогенеза in vivo . В 1993 г. шесть макак-резус были инфицированы патогенным изолятом SIV _mac 239, содержащим или не содержащим Vpr (20). В течение 16 недель последовательности Vpr дикого типа выделяли от трех из пяти животных, инфицированных нулевым вирусом Vpr.Более того, у оставшихся двух животных, инфицированных нулевым вирусом Vpr, наблюдался отсроченный патогенез и реверсия к вирусу, экспрессирующему Vpr, к 66 неделям (20, 21). Эти исследования подтвердили ретроспективную работу, которая обнаружила реверсию внутреннего стоп-кодона Vpr в открытую рамку считывания у случайно инфицированного лабораторного работника и экспериментально инфицированных шимпанзе (22, 23). Вместе эти исследования сыграли важную роль в запуске исследований роли Vpr в патогенезе ВИЧ. Наиболее известно, что Vpr вызывает атаксию-телеангиэктазию и Rad3-зависимый (ATR) ответ на повреждение ДНК, или DDR (24).Vpr-опосредованная активация DDR приводит к остановке клеточного цикла от G ₂ к M в циклических клетках, что вызывает недоумение, поскольку популяции клеток, инфекции которых, по-видимому, больше всего зависят от присутствия Vpr, окончательно дифференцированы и, следовательно, не подвержены остановке клеточного цикла. . Считается, что способность индуцировать остановку клеточного цикла G ₂ в М является преимуществом для вирусной транскрипции, поскольку LTR ВИЧ, как было показано, наиболее активен во время этой фазы клеточного цикла (23, 25). Более того, остатки Vpr, которые придают G ₂ способности к остановке клеточного цикла М, находятся под положительным отбором in vivo и, таким образом, являются наиболее хорошо изученными в данной области (26).Остается определить, необходима ли индукция DDR с помощью Vpr, эволюционно законсервированной функции среди всех лентивирусных белков Vpr приматов (27-29), для установления репликации вируса в метаболически покоящихся иммунных клетках-мишенях, таких как моноциты, макрофаги и DCs.

Vpr / Vpx и важность кооптации убиквитин-лигазы DCAF

Vpx, или вирусный белок x, возник в результате дупликации Vpr после диверсии лентивирусных клонов приматов, которые дали начало ВИЧ-1 и ВИЧ-2 (30, 31).Vpx играет хорошо изученную роль в деградации ретровирусного рестрикционного фактора SAMHD1 (10, 11). В терминально дифференцированных или нециклирующих клетках SAMHD1 снижает концентрацию dNTPs в цитоплазме, тем самым резко ограничивая обратную транскрипцию (32–35). Vpx связывает SAMHD1 с E3-убиквитинлигазой CUL4A-DDB1 DCAF (DCAF ^CRL4 ), что приводит к его полиубиквитинированию и протеасомной деградации (10, 11, 36). Большой интерес вызывает идентификация фактора (ов) рестрикции, на который нацелен Vpr, поскольку он аналогичным образом кооптирует комплекс DCAF ^CRL4 для убиквитинирования белков-мишеней-хозяев.Однако, в отличие от Vpx, инфицирование миелоидных клеток либо ВИЧ-1, либо ВИЧ-2 все еще происходит в отсутствие Vpr, хотя и со значительно разными исходами (19, 24, 37–41). Вероятно, что преимущество репликации, предоставляемое Vpr, заключается в его способности индуцировать DDR, хотя механизмы, с помощью которых Vpr-индуцированная DDR способствует усиленной репликации и распространению вируса in vivo , еще предстоит определить. Множество белков DDR, связанных с комплексом Vpr-DCAF ^CRL4 (24, 37–39, 41), предполагает, что Vpr, кооптируя комплекс белков-хозяев, участвующих во множестве клеточных путей, смог максимизировать свое влияние на интерфейс вируса и хозяина для содействия распространению ВИЧ.

Остатки Vpr, задействованные в DCAF

ЯМР-структура ВИЧ-1 Vpr дает представление о том, как он взаимодействует с множеством белков. Оба N- и C-конца неструктурированы (нуклеотиды 1–16 и 77–96 соответственно) и фланкируют три α-спирали от нуклеотидов 17–33, 38–50 и 56–77 (42). Vpr ВИЧ-2, а также близкородственные аллели Vpr из SIV _smm и SIV _mac , как предполагается, структурно гомологичны таковому из ВИЧ-1.В то время как неструктурированные C- и N-концевые домены способствуют взаимодействию с мишенями-хозяевами, DCAF ^CRL4 — связывающий домен изолирован от третьей α-спирали (42–45). Например, мутанты Vpr ВИЧ-1 Q65R и H71R и соответствующие остатки в аллелях Vpr ВИЧ-2 / SIV _mac попадают в эту область и полностью исключают взаимодействия Vpr-DCAF ^CRL4 . Эти мутации предотвращают опосредованное Vpr усиление транскрипции в MDDC (19), уменьшают деградацию белков ответа на множественные повреждения ДНК (46-50) и предотвращают остановку клеточного цикла G ₂ / M в CD4 + Т-клетках (51).Кроме того, устранение взаимодействия Vpr-DCAF ^CRL4 , как это происходит с мутацией VprQ65R (хотя и не с мутацией VprQ77R), было связано с длительным непрогрессированием in vivo (52). Исследования опосредованного DCAF ^CRL4 усиления инфекции в миелоидных клетках используют эти избранные мутации для определения механизмов действия и, таким образом, заслуживают упоминания.

DCAF

Белки ответа на повреждение ДНК

Урацил ДНК-гликозилаза человека

Макрофаги, происходящие из моноцитов (MDM), имеют высокое соотношение dUTP / TTP в своей цитоплазме, что может привести к неправильному включению урацила в геном с обратной транскрипцией.Было обнаружено, что соотношение dUTP / TTP в макрофагах достигает 60 (53, 54). Урацил-ДНК-гликозилаза человека (hUNG) удаляет неправильно включенный UTP и задействует дополнительные ферменты репарации в месте мутации генома. Таким образом, было выдвинуто предположение, что опосредованное Vpr ВИЧ-1 DCAF ^CRL4 убиквитинирование и протеасомная деградация hUNG ограничивают репликацию вируса либо за счет деградации урацилированной вирусной ДНК до интеграции, либо посредством транскрипционного вмешательства урацилированного провируса (53, 55, 56). ).Однако из-за изначально низких уровней hUNG в MDM (56) полезность урацил-зависимого ограничения ВИЧ-1 в MDM ограничена. Более того, инфицирование MDDCs ВИЧ-1, экспрессирующим hUNG-связывающий дефицитный мутант VprW54R, не приводит ни к ослаблению транскрипции, ни к дефициту вирусного распространения (19). Таким образом, значение деградации hUNG комплексом Vpr-DCAF ^CRL4 (39, 57) остается неясным.

SLX4-SLX / MUS81-EME1

Важность Vpr в пути репарации соединений Холлидея представляет большой интерес, поскольку обещает обеспечить понимание роли Vpr на стадии вирусной интеграции.Исходные сообщения предполагают, что ВИЧ-1 Vpr-DCAF ^CRL4 -опосредованное убиквитинирование MUS81, которое в присутствии фосфорилированного EME1 и киназно-активного PLK1 преждевременно активирует четвертичный эндонуклеазный комплекс SLX4com (47). Было показано, что эта активация предшествует остановке клеточного цикла G ₂ / M и приводит к образованию фокусов FANCD2 в результате активации пути анемии Фанкони (47). В частности, было показано, что связанная с вирионом Vpr-опосредованная активация SLX4com предотвращает продукцию IFN типа I, что имеет большое значение из-за множества генов, стимулированных интерфероном (ISG), которые модулируют функцию миелоидных клеток и определяют эффективность распространения вируса через хозяина. (47).Однако последующие исследования показали только Vpr-DCAF ^CRL4 зависимую деградацию SLX4com субъединиц MUS81-EME1 (50, 58-60) и не выяснили, подавляет ли активный SLX4com детектирование ВИЧ-1 в миелоидных клетках врожденным иммунитетом. Кроме того, взаимодействие SLX4com с Vpr не консервативно среди всех лентивирусных аллелей Vpr приматов (59). В совокупности опубликованные на данный момент результаты предполагают, что Vpr-опосредованная активация SLX4com не играет консервативной роли в подавлении врожденного иммунного обнаружения лентивирусов приматов в миелоидных клетках.

Геликазоподобный фактор транскрипции (HLTF)

Геликазоподобный фактор транскрипции, или HLTF, является мишенью Vpr-опосредованной деградации DCAF ^CRL4 (46, 48). Подобно UNG2 и SLX4-SLX1 / MUS81-EME1, HLTF участвует в репарации повреждений ДНК. В частности, HLTF имеет решающее значение для ремоделирования и восстановления застопорившихся репликационных вилок (61). Хотя HLTF расщепляется в макрофагах зависимым от Vpr-DCAF ^CRL4 образом, неясно, противодействует ли HLTF репликации вируса в миелоидных клетках.

Экзонуклеаза 1

Экзонуклеаза 1, или Exo1, представляет собой 5′-3′-экзонуклеазу Rad2 / XPG, участвующую во многих процессах репарации ДНК, что обеспечивает стабильность генома на протяжении всего клеточного цикла (62). Exo1 недавно был идентифицирован как субстрат для полиубиквитинирования и протеасомной деградации Vpr-DCAF ^CRL4 в CD4 + Т-клетках (49). Авт. Предполагают, что антагонизм Exo1 предотвращает вредный процессинг обратной транскрипции и промежуточных продуктов вирусной интеграции и тем самым приписывает ограничение Exo1 ассоциированному с вирионом Vpr скорее, чем его de novo синтезируемому партнеру (49).На данный момент не показано, что Exo1 играет роль в развитии ВИЧ-1 инфекции макрофагов или дендритных клеток.

Хотя эти опубликованные исследования подчеркивают многочисленные взаимодействия Vpr с различными белками DDR, вклад этих взаимодействий в вирусный патогенез остается неясным. Несмотря на то, что в случае ВИЧ-1-инфекции мало изучены, существует надежная литература, связывающая передачу сигналов врожденного иммунитета и DDR (63, 64). Следует отметить, что манипуляции с DDR не уникальны для ВИЧ.Скорее, это общая патогенная стратегия, широко используемая на взаимодействии хозяев с бактериями и вирусами, которые могут способствовать репликации патогенов и патогенезу (65). Вирус герпеса саркомы Капоши, например, кодирует белок (связанный с латентностью ядерный антиген или LANA), который изолирует Rad50, Mre11 и NBS1, все члены комплекса MRN активатора передачи сигналов DDR, чтобы предотвратить цитоплазматическое зондирование вирусной ДНК и активацию врожденного иммунитета (66 ). Другой пример вирусного нарушения пути DDR включает мышиный γ-герпесвирус, который специфически кодирует orf36, роль которого заключается в индукции ATM-зависимого фосфорилирования DDR и h3AX (67).В отсутствие активации orf36 или ATM репликация вируса ослабляется, что указывает на роль DDR в облегчении репликации вируса (67). В целом очевидно, что Vpr использует DCAF ^CRL4 для индукции DDR с потенциально разными результатами в разных популяциях клеток. Что остается неясным, так это то, как активация DDR и взаимодействие Vpr с белками репарации ДНК позволяет вирусам уклоняться от иммунного обнаружения в миелоидных клетках. Поскольку кинетика обратной транскрипции ВИЧ-1 в миелоидных клетках относительно медленная, есть соблазн предположить, что манипулирование различными путями DDR является консервативной стратегией лентивирусных аллелей Vpr приматов для преодоления преждевременной репарации вирусных промежуточных продуктов обратной транскрипции хозяином (63). , хотя окончательные доказательства этой гипотезы отсутствуют.Скорее всего, активация DDR способствует нескольким дискретным стадиям жизненного цикла вируса. Например, Vpr может индуцировать DDR как через пути ATM, так и через ATR (24, 68). Неразрешенная активность ATM может привести к активации NF-κB (69) и увеличению выработки воспалительных цитокинов, таких как IL-6, оба из которых могут привести к усиленной экспрессии вирусных генов и макрофагозависимой передаче ВИЧ-1 к CD4 + T-клеткам ( 70).

Функции Vpr в дерепрессии транскрипции

Улучшение транскрипции

Предыдущая работа нашей группы показала постинтеграционный дефект в дендритных клетках, происходящих из моноцитов (MDDC), инфицированных Vpr-дефицитным ВИЧ-1 (19).Инфекции в отсутствие Vpr, ассоциированного с вирионом, характеризовались низкой провирусной транскрипцией, несмотря на аналогичные уровни интеграции, и снижением инфицирования CD4 + Т-клеток в совместных культурах (19). Этот дефект зависит от связывания Vpr с DCAF ^CRL4 , поскольку он полностью устраняется при инфицировании мутантами Vpr (Q65R или H71R), лишенными взаимодействий DCAF ^CRL4 . Следует отметить, что многие вирусы, помимо ВИЧ-1, в первую очередь вирус гепатита B, также могут манипулировать убиквитинлигазой E3 DCAF ^CRL4 для усиления транскрипции (71).Хотя механизм Vpr-опосредованного усиления транскрипции ВИЧ-1 остается неясным, предыдущие исследования показали, что Vpr-опосредованная деградация HDAC (38) и членов комплекса ремоделирования хроматина NuRD (72) может усиливать транскрипцию в глобальном масштабе. Кроме того, DCAF ^CRL4 также играет хорошо известную роль в деградации репрессора транскрипции, ATF3, который необходим для коррекции УФ-повреждений (73). Это объяснение не является удовлетворительным, учитывая зависимость усиления транскрипции от типа клеток.Разложен или изолирован специфичный для MDDC репрессор / активатор, остается неизвестным и требует дальнейшего исследования.

ТЕТ2

Недавно было показано, что члены семейства TET ДНК-диоксигеназ разлагаются зависимым образом от Vpr-DCAF ^CRL4 (70). В миелоидных клетках TET2 естественно моноубиквитинируется. N-терминальное моноубиквитилирование TET2 делает возможным эффективное связывание с хроматином и последующее задействование аппарата ремоделирования хроматина и факторов транскрипции.Однако в присутствии Vpr TET2 быстро полиубиквитинируется в сайте, независимом от его природного сайта моноубиквитилирования, и подвергается DCAF ^CRL4 -зависимой протеасомной деградации (70). Это актуально для миелоидных клеток, поскольку TET2 является вышестоящим супрессором экспрессии IL-6. TET2 рекрутирует HDAC1 и HDAC2 на промотор IL-6, тем самым подавляя транскрипцию IL-6. Важно отметить, что в макрофагах, происходящих из моноцитов, и в линии моноцитарных клеток THP-1 отсутствие Vpr-опосредованной деградации TET2 было связано со сниженным высвобождением вирусных частиц и более медленным распространением инфекции ВИЧ-1.После нокаута TET2 различия в инфекции между Vpr-компетентными и Vpr-дефицитными вирусами были потеряны. Поскольку IL-6 долгое время считался усилителем транскрипции ВИЧ в моноцитах (70, 74–76), эти данные дополнительно наводят на мысль о прямой связи между Vpr, деградацией TET2 и устойчивым продуцированием IL-6, что может привести к повышенная эффективность распространения вируса от миелоидных клеток к CD4 + Т-клеткам.

Эпигенетическая регуляция провируса

До недавнего времени не было известно, существуют ли внутренние механизмы хозяина для ограничения ретровирусной репликации после интеграции.Однако недавние исследования идентифицировали новый метод внутриклеточного ограничения: метод отложения меток метилирования, подавляющего транскрипцию, на провирусных LTR. После обратной транскрипции и интеграции LTR провирусов в гетерохроматине метилируются посредством последовательного рекрутирования HP1, а метилтрансфераза Suv39h2 (77). Триметилированный h4K9 рекрутирует комплекс HUSH (HUman Silencing Hub), состоящий из трех компонентов; ТАСОР, МПП8 и перифилин (78).Хотя комплекс HUSH сам по себе не обладает активностью метилтрансферазы, HUSH рекрутирует метилазу SETDB1, которая индуцирует дальнейшее метилирование h4K9me3 провируса. Примечательно, что shRNA-опосредованный нокдаун каждого сложного белка HUSH спасает экспрессию эндогенного и экзогенного ретровирусного гена, тем самым показывая важность его четвертичной сборки для репрессии транскрипции (78). Интересно, что TASOR нацелен клонов Vpx SIVmac / HIV-2 для DCAF ^CRL4 -опосредованного полиубиквитинирования и протеасомной деградации, тем самым увеличивая транскрипционную активность провирусов, которая в противном случае была бы подавлена ​​(78-80).В то время как комплекс HUSH может репрессировать транскрипцию из интегрированного LTR ВИЧ-1 (78, 80, 81), удивительно, что Vpr ВИЧ-1 не нацелен на белки комплекса HUSH для деградации (79). Однако было показано, что множественные аллели Vpr от лентивирусов предков приматов к ВИЧ-1, включая аллели, происходящие от SIV _AGM , SIV _MUS2 и SIV _SAB , предотвращают опосредованное HUSH молчание (79, 80). Эти исследования знаменуют начало исследований антагонизма Vpx / Vpr противовирусных белков хозяина на уровне провирусной ДНК.Хотя HUSH-опосредованное подавление транскрипции не является специфическим для миелоида противовирусным механизмом, комплекс HUSH и связанные с ним фасилитаторы активны в миелоидных клонах. Недавние исследования в литературе предоставляют доказательства эпигенетического контроля провоспалительных цитокиновых ответов в макрофагах (82, 83). Например, гистоновые метилтрансферазы, SETDB1 и Smyd2, сильно подавляют TLR4-опосредованную индукцию продукции IL-6 и TNFα, а мыши с макрофаг-специфическим дефицитом SetDB1 гиперчувствительны к провокации эндотоксином (82).Хотя антагонизм комплекса HUSH не был приписан Vpr ВИЧ-1, подавление транскрипции LTR ВИЧ-1 в MDDC в отсутствие Vpr (19) предполагает существование дополнительных механизмов внутренней репрессии транскрипции миелоидными клетками, на которые нацелены ВИЧ-1 Впр.

Дайсер и процессинг miRNA

Модуляция путей РНК-интерференции (RNAi) и микроРНК (miRNA) является неотъемлемым средством, с помощью которого патогены узурпируют функции хозяина в свою пользу (84, 85).В частности, давно известно, что микроРНК играют роль в репликации ВИЧ во многих популяциях клеток. Например, miR-29a участвует в подавлении уровней мРНК ВИЧ посредством связывания с 3′-UTR РНК ВИЧ и последующего прикрепления к белкам P-тельца и комплексам RISC (86). Дайсер необходим для обработки субстратов пре-miRNA, чтобы выявить двухцепочечный комплекс miRNA, который затем связывается с комплексом RISC и подавляет экспрессию целевой мРНК либо посредством ингибирования трансляции, либо посредством деградации мРНК (87).Недавние исследования также продемонстрировали способность miRNA отрицательно регулировать провоспалительные реакции в макрофагах путем ограничения ремоделирования хроматина и усиления транскрипционного молчания промоторов выбранных воспалительных генов (88). Интересно, что Dicer был идентифицирован в комплексе с Vpr-DCAF ^CRL4 до его деградации и истощения Dicer в инфицированных MDM, как было показано, увеличивает репликацию вируса с помощью неизвестных механизмов (89). Мы утверждаем, что Vpr-Dicer-зависимая модуляция экспрессии выбранной miRNA может вносить вклад в дерепрессию воспалительных реакций.Следует отметить, что Vpr-опосредованное истощение Dicer также было показано в CD4 + Т-клетках и, как таковое, не является миелоид-специфическим антагонистом врожденной рестрикции (89). Роль деградации Dicer еще предстоит полностью понять, особенно в связи с расширением исследований функции miRNA и RNAi в патогенезе ВИЧ (90).

DCAF

Обращение с конвертами

Миелоидные клетки часто населяют ткани слизистых оболочек и, как таковые, способны распространять ВИЧ с периферии к участкам, где в большом количестве находятся активированные CD4 + Т-клетки.Макрофаги и дендритные клетки способны переносить вирус через цис- или транс-инфекцию. Оба метода способствуют концентрации вирионов в инфекционном синапсе и тем самым значительно увеличивают вероятность заражения CD4 + Т-клетками (9, 91, 92). Два исследования изучали роль Vpr в концентрации и доставке вируса в вирусологический синапс. Оба этих исследования показывают, что в отсутствие Vpr, Env-положительные вирионы доставляются в лизосомы для деградации, тем самым снижая эффективность распространения макрофагов для CD4 + T-клеточного вируса при низкой множественности инфекции (93, 94).Напротив, наши исследования того, способствует ли Vpr уклонению от этого Env-зависимого снижения высвобождения вируса в других типах клеток, таких как MDDC, не дали аналогичных результатов (19), предполагая, что влияние Vpr на экспрессию Env может быть ограничено до специфические типы клеток и не всегда наблюдаются.

IFN типа I и провоспалительные реакции

Появляется все больше свидетельств того, что Vpr модулирует иммунный ответ миелоидных клеток, способствуя репликации и распространению вируса по всему хозяину.Ранние исследования предполагали возможный дефект активации MDM и MDDC при лечении рекомбинантным Vpr (95). Этот дефект характеризовался низкой экспрессией CD33 на поверхности, плохой активацией CD80 / 86 и нарушенной презентацией антигена активированным CD4 + Т-клеткам (95). В отличие от исследований, в которых использовалось экзогенное добавление рекомбинантного Vpr, преобладали исследования, изучающие роль Vpr в контексте вирусной инфекции. Например, de novo экспрессия Vpr в продуктивно инфицированных MDDC индуцировала продукцию провоспалительных цитокинов (TNF-α, IL-6 и IL-8) (70, 96, 97).Предыдущая работа нашей группы показала усиление провирусной транскрипции в MDDC в присутствии Vpr (19). Другие исследования аналогичным образом показали роль Vpr в провирусной транскрипции. Лю и др. показали, что Vpr изменяет доступность гетеродимера NF-κB p50-p65 и AP1 (98), оба из которых необходимы для инициации транскрипции ВИЧ с 5′-LTR (99, 100) и экспрессии провоспалительных цитокинов. В этом исследовании было показано, что Vpr облегчает полиубиквитинирование и последующее фосфорилирование (активацию) TAK1, вышестоящего регулятора NF-κB и AP1 (98).Прерывание фосфорилирования TAK1 и, таким образом, ингибирование его активации, значительно снижает провирусную транскрипцию (98).

Как наше исследование (19), так и работа, показывающая Vpr-опосредованную модификацию TAK1 (98), важны в свете недавней идентификации нового пути обнаружения вируса: такого, в котором хозяин зондирования de novo экспрессирует интрон-содержащий ВИЧ. -1 РНК (icRNA ВИЧ) в MDM и MDDC приводит к экспрессии ISG и продукции провоспалительных хемокинов и цитокинов, включая IP-10 и IL-15 (101).IP-10 представляет собой воспалительный хемокин и лиганд рецептора CXCR3 (102), в то время как IL-15 является цитокином γ-цепи, критическим для пролиферации и гомеостаза Т-клеток (103). CXCR3 экспрессируется на активированных CD4 + Т-клетках, и, таким образом, секреция IP-10 продуктивно инфицированными миелоидными клетками может привести к дополнительному привлечению чувствительных к вирусу клеток в сайты репликации вируса в периферических тканях. Кроме того, воздействие IL-15 может приводить к фосфорилированию SAMHD1 и инактивации его активности dNTPase, тем самым снимая ограничения на репликацию вируса в покоящихся CD4 + Т-клетках (104).Интересно, что ингибитор TAK1 снижает продукцию IP-10 из макрофагов, инфицированных ВИЧ-1 (101). Таким образом, в этой модели Vpr-зависимая усиленная провирусная транскрипция потенциально увеличивает пул вирусных icRNA, подверженных внутреннему иммунному восприятию клетки, что приводит к установлению провоспалительного состояния и усиленному распространению вируса.

Следует отметить, что увеличение вирусной транскрипции в миелоидных клетках является палкой о двух концах для ВИЧ, поскольку также происходит индукция экспрессии ISG и установление предполагаемого антивирусного состояния.Хотя механизм восприятия нуклеиновой кислоты, ответственный за обнаружение icRNA ВИЧ, еще не определен, Vpr может блокировать фосфорилирование и ядерную транслокацию фактора регуляции интерферона 3 (IRF3), индуцируя убиквитинирование и протеосомную деградацию IRF3, хотя это было показано только для CD4 +. Линии Т-клеток (105). Кроме того, было показано, что Vpr связывается с TBK1 в миелоидных клетках и предотвращает его фосфорилирование, тем самым предотвращая индукцию продукции IFN типа I (106). Таким образом, мы утверждаем, что Vpr может действовать, способствуя NF-κB-зависимым провоспалительным ответам, одновременно способствуя подавлению индукции противовирусной защиты хозяина.Более того, индукция ISG, таких как CD169, в MDM и MDDC при восприятии хозяином icRNA ВИЧ в миелоидных клетках (101) может еще больше склонить чашу весов к усиленному распространению вируса, а не к ограничению вируса. Например, индуцированная экспрессия CD169 на ВИЧ-инфицированных макрофагах и дендритных клетках может способствовать передаче CD4 + Т-клеток от клетки к клетке через инфекционные синапсы (101, 107, 108). Вместе эти исследования указывают на роль Vpr как белка, который тщательно управляет множеством вирусных сенсорных систем, чтобы вызвать рекрутирование дополнительных клеточных мишеней вируса, избегая при этом противовирусного иммунитета.

Заключение

Очевидно, что Vpr играет важную роль в инфицировании миелоидных клеток (см. Рисунок 1). Ряд тканевых макрофагов, таких как микроглия, клетки Купфера, альвеолярные, кишечные, тестикулярные и вагинальные макрофаги, содержат провирусную ДНК (109–113), а тканевые макрофаги, по оценкам, компрометируют до 4% инфицированных клеток в vivo (114) и, что важно, может оставаться устойчиво инфицированным ВИЧ-1 даже в присутствии АРТ (109–112, 115).Возможно, что Vpr-опосредованная DDR активирует провоспалительное состояние, которое способствует созданию резидентного в тканях резервуара миелоидных клеток, в результате чего вирус эффективно распространяется благодаря устойчивому производству вирионов и усилению межклеточных контактов между ВИЧ-инфицированными миелоидными клетками. клетки и CD4 + Т-клетки. Таким образом, инфекция миелоидных клеток является мостом между относительно враждебными участками заражения вирусом (в первую очередь, периферическими тканями слизистой оболочки) и ключевой мишенью ВИЧ; CD4 + Т-клетки.Кажется вероятным, что истинная ценность Vpr in vivo заключается в его универсальности, позволяющей избежать вирусного ограничения как до, так и после интеграции в миелоидные клетки. В будущих исследованиях необходимо будет рассмотреть относительную важность каждой из известных функций Vpr in vivo .

Рисунок 1 . Роль Vpr в инфицировании миелоидных клеток. Краткое изложение многочисленных функций, которые Vpr играет в миелоидных клетках, от усиления транскрипции и индукции DDR до секреции провоспалительных цитокинов.Красным цветом показаны процессы, в которых Vpr был непосредственно исследован.

Взносы авторов

Все перечисленные авторы внесли существенный, прямой и интеллектуальный вклад в работу и одобрили ее к публикации.

Финансирование

Эта работа была поддержана грантами NIH R01AI064099, P30AI042853 и R01AG060890 (SG).

Заявление о конфликте интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Список литературы

2. Баррето-де-Соуза В., Аракелян А., Марголис Л., Ванпуй К. Передача ВИЧ-1 вагинальным путем: внеклеточный или связанный с клетками вирус? Am J Reproduc Immunol. (2014) 71: 589–99. DOI: 10.1111 / aji.12240

CrossRef Полный текст | Google Scholar

3. Бургенер А., Макгоуэн И., Клатт Н.Р. Взаимодействие ВИЧ и слизистого барьера: последствия для передачи и патогенеза. Курр Опин Иммунол . (2015) 36: 22–30. DOI: 10.1016 / j.coi.2015.06.004

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

4. Пена-Круз В., Агосто Л.М., Акияма Х., Олсон А., Моро И., Ларрие Дж. Р. и др. ВИЧ-1 реплицируется и сохраняется в эпителиальных дендритных клетках влагалища. Дж. Клин Инвест . (2018) 128: 3439–44. DOI: 10.1172 / JCI98943

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

5. Родригес-Гарсия М., Шен З., Барр Ф. Д., Бош А. В., Акерман М. Е., Каппес Дж. К. и др. Дендритные клетки женского репродуктивного тракта человека быстро захватывают ВИЧ и реагируют на него. Иммунол слизистой оболочки . (2017) 10: 531–44. DOI: 10,1038 / mi.2016.72

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

7. Peressin M, Proust A, Schmidt S, Su B, Lambotin M, Biedma ME, et al. Эффективный перенос ВИЧ-1 в транс- и цис-форме от дендритных клеток Лангерганса и макрофагов к аутологичным Т-лимфоцитам. СПИД . (2014) 28: 667–77. DOI: 10.1097 / QAD.0000000000000193

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

8.Турвилл С.Г., Сантос Дж. Дж., Фрэнк И., Кэмерон ПУ, Уилкинсон Дж., Миранда-Саксена М. и др. Поглощение вируса иммунодефицита, оборот и двухфазный перенос в дендритных клетках человека. Кровь . (2004) 103: 2170–9. DOI: 10.1182 / кровь-2003-09-3129

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

10. Грецка К., Хао С., Гершевска М., Суонсон С.К., Кесик-Бродацка М., Шривастава С. и др. Vpx снимает подавление ВИЧ-1 инфекции макрофагов, опосредованной белком SAMHD1. Природа . (2011) 474: 658–61. DOI: 10.1038 / nature10195

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

11. Laguette N, Sobhian B., Casartelli N, Ringeard M, Chable-Bessia C., Ségéral E, et al. SAMHD1 представляет собой специфический для дендритных и миелоидных клеток фактор рестрикции ВИЧ-1, которому противодействует Vpx. Природа . (2011) 474: 654–7. DOI: 10.1038 / природа10117

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

13. Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH.Выделение человеческого гена, который подавляет инфекцию ВИЧ-1 и подавляется вирусным белком Vif. Природа . (2002) 418: 646–50. DOI: 10.1038 / nature00939

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

14. Селиг Л., Пейдж Дж. К., Танчу В., Превераль С., Берлиоз-Торрент С., Лю LX и др. Взаимодействие с доменом p6 предшественника gag опосредует включение в вирионы белков Vpr и Vpx из лентивирусов приматов. Дж Вирол . (1999) 73: 592–600.

PubMed Аннотация | Google Scholar

15. Пакстон В., Коннор Р.И., Ландау Н.Р. Включение Vpr в вирионы вируса иммунодефицита человека типа 1: потребность в области p6 gag и мутационного анализа. J Virol. (1993) 67: 7229–37.

PubMed Аннотация | Google Scholar

16. Кэмпбелл Б.Дж., Хирш В.М. Vpr вируса обезьяньего иммунодефицита африканских зеленых мартышек необходим для репликации в макрофагах и лимфоцитах макак. Дж Вирол .(1997) 71: 5593–602.

PubMed Аннотация | Google Scholar

17. Коннор Р.И., Чен Б.К., Чхве С., Ландау Н.Р. Vpr необходим для эффективной репликации вируса иммунодефицита человека типа 1 в мононуклеарных фагоцитах. Вирусология . (1995) 206: 935–44. DOI: 10.1006 / viro.1995.1016

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

18. Экштейн Д.А., Шерман М.П., ​​Пенн М.Л., Чин П.С., Грин В.С., Голдсмит М.А. Vpr ВИЧ-1 увеличивает вирусную нагрузку, облегчая инфицирование тканевых макрофагов, но не деля CD4 + Т-клетки. J Exp Med . (2001) 194: 1407–19. DOI: 10.1084 / jem.194.10.1407

CrossRef Полный текст | Google Scholar

19. Миллер С.М., Акияма Х., Агосто Л.М., Эмери А., Эттингер С.Р., Сванстром Р.И. и др. Связанный с вирионом Vpr снижает постинтеграционную блокаду ВИЧ-1 инфекции дендритных клеток. Дж Вирол . (2017) 91: e00051-17. DOI: 10.1128 / JVI.00051-17

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

20. Ланг SMM, Вигер С., Шталь-Хенниг С., Кулибали Дж., Хунсманн Дж., Мюллер Х. и др.Важность Vpr для заражения макак-резусов вирусом иммунодефицита обезьян. Дж Вирол . (1993) 67: 902–12.

PubMed Аннотация | Google Scholar

21. Hoch J SM, Lang M, Weeger C, Stahl-Hennig C., Coulibaly U, Dittmer G, et al. Мутант с делецией vpr вируса иммунодефицита обезьян вызывает СПИД у макак-резусов. Дж Вирол . (1995) 69: 4807–13.

PubMed Аннотация | Google Scholar

22. Бомонт Т., ван Нуэнен А., Броерсен С., Блаттнер В.А., Лукашов В.В., Шуйтмейкер Х.Обращение вируса иммунодефицита человека типа 1 IIIB к фенотипу, устойчивому к нейтрализации, у случайно инфицированного лабораторного работника с прогрессирующим клиническим течением. Дж Вирол . (2001) 75: 2246–52. DOI: 10.1128 / JVI.75.5.2246-2252.2001

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

23. Goh WC, Rogel ME, Kinsey CM, Michael SF, Fultz PN, Nowak MA, et al. Vpr ВИЧ-1 увеличивает экспрессию вируса путем манипулирования клеточным циклом: механизм отбора Vpr in vivo . Нат Мед . (1998) 4:65. DOI: 10,1038 / нм0198-065

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

24. Рошаль М., Ким Б., Чжу И., Нгием П., Планеллес В. Активация ATR-опосредованного ответа на повреждение ДНК вирусным белком ВИЧ-1 R. J Biol Chem . (2003) 278: 25879–86. DOI: 10.1074 / jbc.M303948200

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

25. Гуммулуру С., Эмерман М. Клеточный цикл и Vpr-опосредованная регуляция экспрессии вируса иммунодефицита человека типа 1 в первичных и трансформированных Т-клеточных линиях. Дж Вирол . (1999) 73: 5422–30.

PubMed Аннотация | Google Scholar

26. Yedavalli VR, Chappey C, Ahmad N. Сохранение интактного гена vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 после передачи от матери ребенку. Дж Вирол . (1998) 72: 6937–43.

PubMed Аннотация | Google Scholar

28. Planelles V, Jowett JB, Li QX, Xie Y, Hahn B., Chen IS. Vpr-индуцированная остановка клеточного цикла консервативна среди лентивирусов приматов. Дж Вирол .(1996) 70: 2516–24.

PubMed Аннотация | Google Scholar

29. Stivahtis GL, Soares MA, Vodicka MA, Hahn BH, Emerman M. Сохранение и специфичность хозяина Vpr-опосредованной остановки клеточного цикла предполагают фундаментальную роль в эволюции и биологии лентивируса приматов. Дж Вирол . (1997) 71: 4331–8.

PubMed Аннотация | Google Scholar

30. Фрегосо О.И., Ан Дж., Ван С., Меренс Дж., Сковронски Дж., Эмерман М. Эволюционное переключение специфичности Vpx / Vpr приводит к дивергентному распознаванию рестрикционного фактора SAMHD1. PLoS Патог . (2013) 9: e1003496. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1003496

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

31. Лим ES, Fregoso OI, McCoy CO, Matsen FA, Malik HS, Emerman M. Способность лентивирусов приматов разрушать фактор рестрикции моноцитов SAMHD1 предшествовала рождению вирусного вспомогательного белка Vpx. Клеточный микроб-хозяин . (2012) 11: 194–204. DOI: 10.1016 / j.chom.2012.01.004

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

32.Baldauf HM, Pan X, Erikson E, Schmidt S, Daddacha W., Burggraf M, et al. SAMHD1 ограничивает инфекцию ВИЧ-1 в покоящихся CD4 (+) Т-клетках. Нат Мед . (2012) 18: 1682–7. DOI: 10,1038 / нм.2964

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

33. Гужон С., Арфи В., Пертел Т., Любан Дж., Лиенард Дж., Ригал Д. и др. Характеристика функции Vpx вируса иммунодефицита обезьян SIVSM / вируса иммунодефицита человека 2 типа в миелоидных клетках человека. Дж Вирол . (2008) 82: 12335–45.DOI: 10.1128 / JVI.01181-08

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

34. Лахуасса Х., Даддача В., Хофманн Х., Айинде Д., Лог Э. К., Драгин Л. и др. SAMHD1 ограничивает репликацию вируса иммунодефицита человека типа 1, истощая внутриклеточный пул дезоксинуклеозидтрифосфатов. Нат Иммунол . (2012) 13: 223–8. DOI: 10.1038 / ni.2236

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

35. Descours B, Cribier A, Chable-Bessia C, Ayinde D, Rice G, Crow Y и др.SAMHD1 ограничивает обратную транскрипцию ВИЧ-1 в покоящихся CD4 (+) Т-клетках, Retrovirology . (2012) 9:87. DOI: 10.1186 / 1742-4690-9-87

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

36. Hofmann H, Logue EC, Bloch N, Daddacha W., Polsky SB, Schultz ML, et al. Дополнительный лентивирусный белок Vpx нацелен на деградацию SAMHD1 в ядре. Дж Вирол . (2012) 86: 12552–60. DOI: 10.1128 / JVI.01657-12

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

37.Белзил Дж. П., Ричард Дж., Ружо Н., Сяо Ю., Коэн Э. А.. Vpr ВИЧ-1 индуцирует K48-связанное полиубиквитинирование и протеасомную деградацию целевых клеточных белков, чтобы активировать ATR и способствовать остановке G2. Дж Вирол . (2010) 84: 3320–30. DOI: 10.1128 / JVI.02590-09

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

38. Romani B, Baygloo NS, Hamidi-Fard M, Aghasadeghi MR, Allahbakhshi E. Белок Vpr ВИЧ-1 индуцирует протеасомную деградацию ассоциированных с хроматином HDAC класса I для преодоления латентной инфекции макрофагов. Дж. Биол. Хим. . (2016) 291: 2696–711. DOI: 10.1074 / jbc.M115.689018

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

39. Schröfelbauer B, Yu Q, Zeitlin SG, Landau NR. Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 индуцирует деградацию урацил-ДНК гликозилаз UNG и SMUG. Дж Вирол . (2005) 79: 10978–87. DOI: 10.1128 / JVI.79.17.10978-10987.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

40. Уэно Ф., Шиота Х., Мияура М., Йошида А., Сакураи А., Тацуки Дж. И др.Белки Vpx и Vpr ВИЧ-2 регулируют вирусную инфекционность посредством особого механизма в лимфоцитарных клетках. Микробы заражают . (2003) 5: 387–95. DOI: 10.1016 / S1286-4579 (03) 00042-X

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

41. Ван Х, Го Х, Су Дж, Жуй Й, Чжэн В., Гао В. и др. Ингибирование Vpx-опосредованной деградации фактора транскрипции SAMHD1 и Vpr-хеликазы хозяина путем селективного нарушения сборки вирусной CRL4 (DCAF1) E3 убиквитинлигазы. Дж Вирол . (2017) 91: e00225-17 DOI: 10.1128 / JVI.00225-17

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

44. Wu Y, Zhou X, Barnes CO, DeLucia M, Cohen AE, Gronenborn AM, et al. Кристаллическая структура DDB1-DCAF1-Vpr-UNG2 показывает, как Vpr ВИЧ-1 направляет человеческий UNG2 к разрушению. Нат Струк Мол Биол . (2016) 23: 933–40. DOI: 10.1038 / nsmb.3284

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

45. Чжао Л.Дж., Мукерджи С., Нараян О.Биохимический механизм функции Vpr ВИЧ-I. Специфическое взаимодействие с клеточным белком. Дж. Биол. Хим. . (1994) 269: 15577–82.

PubMed Аннотация | Google Scholar

46. Грецка К., Хао Ц., Шун М. – Ц., Каур С., Свансон С. К., Флоренс Л. и др. ВИЧ-1 и ВИЧ-2 проявляют различные взаимодействия с белками репарации ДНК HLTF и UNG2. Труды Национальной академии наук . (2016) 113, E3921 – E30. DOI: 10.1073 / pnas.1605023113

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

47.Laguette N, Brégnard C, Hue P, Basbous J, Yatim A, Larroque M и др. Преждевременная активация комплекса SLX4 с помощью Vpr способствует остановке G2 / M и уходу от врожденного иммунного восприятия. Ячейка . (2014) 156: 134–45. DOI: 10.1016 / j.cell.2013.12.011

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

48. Lahouassa H, Blondot ML, Chauveau L, Chougui G, Morel M, Leduc M, et al. Vpr ВИЧ-1 разрушает ДНК-транслоказу HLTF в Т-клетках и макрофагах. Труды Национальной академии наук .(2016) 113: 5311–6. DOI: 10.1073 / pnas.1600485113

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

49. Янь Дж., Шун М.К., Хао С., Чжан Ю., Цянь Дж., Хрека К. и др. (2018). Vpr ВИЧ-1 перепрограммирует CLR4 ^DCAF1 E3 убиквитинлигазу для противодействия ограничению инфекции ВИЧ-1, опосредованной экзонуклеазой 1. мБио. 9 . DOI: 10.1128 / mBio.01732-18

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

50. Чжоу X, ДеЛусия М., Ан Дж.SLX4-SLX1, независимое от белка подавление белка MUS81-EME1 вирусным белком R (Vpr) ВИЧ-1. Журнал биологической химии . (2016) 291: 16936–47. DOI: 10.1074 / jbc.M116.721183

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

51. Rouzic EL, Belaïdouni N, Estrabaud E, Morel M, Rain J-C, Transy C., et al. (2007). Vpr ВИЧ1 останавливает клеточный цикл, рекрутируя DCAF1 / VprBP. рецептор убиквитинлигазы Cul4-DDB1. Cell Cycle , 6: 182–188.DOI: 10.4161 / cc.6.2.3732

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

52. Жако Дж., Ле Рузик Е., Майду-Пиндара П., Мэйзи М., Лефрер Дж. Дж., Данелуцци В. и др. (2009). Характеристика молекулярных детерминант первичных белков Vpr ВИЧ-1: влияние замен Q65R и R77Q на функции Vpr. PLOS ONE . 4: e7514. DOI: 10.1371 / journal.pone.0007514

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

53.Hansen EC, Ransom M, Hesselberth JR, Hosmane NN, Capoferri AA, Bruner KM, et al. Различная судьба урацилированной ДНК ВИЧ-1 при инфицировании клеток миелоидной линии. eLife . (2016) 5: e18447. DOI: 10.7554 / eLife.18447

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

54. Кеннеди Е.М., Даддача В., Слейтер Р., Гавеньяно С., Фроментин Е., Схинази Р.Ф. и др. Обильный неканонический dUTP, обнаруженный в первичных макрофагах человека, способствует его частому включению обратной транскриптазой ВИЧ-1. Дж. Биол. Хим. . (2011) 286: 25047–55. DOI: 10.1074 / jbc.M111.234047

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

55. Ланжевен К., Майду-Пиндара П., Аас П.А., Жако Г., Оттерлей М., Слуппхауг Г. и др. Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 модулирует клеточную экспрессию UNG2 посредством отрицательного транскрипционного эффекта. Дж Вирол . (2009) 83: 10256–63. DOI: 10.1128 / JVI.02654-08

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

56.Weil AF, Ghosh D, Zhou Y, Seiple L, McMahon MA, Spivak AM и др. Урацил-ДНК-гликозилаза инициирует деградацию кДНК ВИЧ-1, содержащей неправильно включенный dUTP, и предотвращает интеграцию вируса. Труды Национальной академии наук . (2013) 110: E448 – E57. DOI: 10.1073 / pnas.1219702110

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

57. Ан Дж., Ву Т., Новинце З., Герреро-Санторо Дж., Рапик-Отрин В., Гроненборн А.М. Vpr ВИЧ-1 загружает урацил ДНК-гликозилазу-2 на DCAF1, субъединицу распознавания субстрата убиквитинлигазы Cullin 4A-RING E3 для протеасомозависимой деградации. Журнал биологической химии . (2010) 285: 37333–41. DOI: 10.1074 / jbc.M110.133181

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

58. Бергер Г., Лоуренс М., Хью С., Нил С.Дж. (2014). Остановка клеточного цикла G2 / M коррелирует с взаимодействием лентивируса Vpr приматов с комплексом SLX4. Дж Вирол . 89: 230–240. DOI: 10.1128 / JVI.02307-14

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

59. Фрегосо О.И., Эмерман М.(2016). Активация ответа на повреждение ДНК является консервативной функцией Vpr ВИЧ-1 и ВИЧ-2, которая не зависит от рекрутирования SLX4. мБио.7 . DOI: 10.1128 / mBio.01433-16

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

60. Гринвуд Э.Д., Уильямсон Дж. С., Сенкевич А., Наамати А., Матесон, штат Нью-Джерси, Ленер П. Дж.. Беспорядочное нацеливание на клеточные белки с помощью Vpr управляет протеомным ремоделированием системного уровня при ВИЧ-1-инфекции. Cell Rep. (2019) 27: 1579–96e7.DOI: 10.1016 / j.celrep.2019.04.025

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

61. Achar YJ, Balogh D, Haracska L. Скоординированное ремоделирование белка и ДНК человеческим HLTF на остановленной репликационной вилке. Proc Natl Acad Sci USA . (2011) 108: 14073–8. DOI: 10.1073 / pnas.1101951108

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

62. Кейзерс Г., Бакула Д., Петр М.А., Мадсен НГК, Теклу А., Мкртчян Г. и др. Регуляторные функции экзонуклеазы 1 человека (EXO1) в репликации ДНК с предполагаемой ролью при раке. Int J Mol Sci. (2018) 20:74. DOI: 10.3390 / ijms20010074

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

66. Мариджио Дж., Кох С., Чжан Дж., Вайднер-Глунде М., Рукерт Дж., Кати С. и др. Ядерный антиген, связанный с латентностью вируса герпеса саркомы Капоши (KSHV) (LANA), привлекает компоненты комплекса репарации MRN (Mre11-Rad50-NBS1) для модуляции сигнального пути врожденного иммунитета и вирусной латентности. PLoS Патог . (2017) 13: e1006335. DOI: 10,1371 / журнал.ппат.1006335

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

67. Тараканова В.Л., Леунг-Пинеда В., Хван С., Ян К.В., Мататалл К., Бассон М. и др. Гамма-герпесвирусная киназа активно инициирует ответ на повреждение ДНК, индуцируя фосфорилирование h3AX, чтобы способствовать репликации вируса. Клеточный микроб-хозяин . (2007) 1: 275–86. DOI: 10.1016 / j.chom.2007.05.008

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

68. Накай-Мураками К., Шимура М., Киномото М., Такидзава Ю., Токунага К., Тагучи Т. и др.Vpr ВИЧ-1 индуцирует ATM-зависимый клеточный сигнал с усиленной гомологичной рекомбинацией. Онкоген . (2007) 26: 477–86. DOI: 10.1038 / sj.onc.1209831

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

69. Wu ZH, Shi Y, Tibbetts RS, Miyamoto S. Молекулярная связь между киназой ATM и передачей сигналов NF-kappaB в ответ на генотоксические стимулы. Наука . (2006) 311: 1141–6. DOI: 10.1126 / science.1121513

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

70.Lv L, Wang Q, Xu Y, Tsao LC, Nakagawa T., Guo H, et al. Vpr нацелен на TET2 для деградации лигазой CRL4VprBP E3 для поддержания экспрессии IL-6 и усиления репликации ВИЧ-1. Мол Ячейки . (2018) 70: 961–70.e5. DOI: 10.1016 / j.molcel.2018.05.007

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

71. van Breugel PC, Robert EI, Mueller H, Decorsière A, Zoulim F, Hantz O, et al. Белок Х вируса гепатита В стимулирует экспрессию генов избирательно из внехромосомных ДНК-матриц. Гепатология . (2012) 56: 2116–24. DOI: 10.1002 / hep.25928

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

72. Maudet C, Sourisce A, Dragin L, Lahouassa H, Rain J-C, Bouaziz S, et al. Vpr ВИЧ-1 индуцирует деградацию ZIP и sZIP, адаптеров комплекса ремоделирования хроматина NuRD, путем захвата DCAF1 / VprBP. PLOS ONE . (2013) 8: e77320. DOI: 10.1371 / journal.pone.0077320

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

73.Епанчинцев А., Костанцо Ф., Раушендорф М.А., Капуто М., Йе Т, Доннио Л.М. и др. Белки А и В синдрома Кокейнса регулируют остановку транскрипции после генотоксического стресса, способствуя деградации ATF3. Мол Ячейки . (2017) 68: 1054–66.e6. DOI: 10.1016 / j.molcel.2017.11.009

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

74. Поли Г., Бресслер П., Кинтер А., Ду Е., Тиммер В. К., Рабсон А. и др. Интерлейкин 6 индуцирует экспрессию вируса иммунодефицита человека в инфицированных моноцитарных клетках в одиночку и в синергии с фактором некроза опухоли альфа за счет транскрипционных и посттранскрипционных механизмов. J Exp Med . (1990) 172: 151–8. DOI: 10.1084 / jem.172.1.151

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

75. Weissman D, Poli G, Fauci AS. Интерлейкин 10 блокирует репликацию ВИЧ в макрофагах путем ингибирования аутокринной петли фактора некроза опухоли α и индукции интерлейкина 6 вируса. Ретровирусы AIDS Res Hum . (1994) 10: 1199–206. DOI: 10.1089 / помощь.1994.10.1199

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

76.Чжан Ц., Чжао К., Шен Ц., Хань И, Гу И, Ли Х и др. Tet2 необходим для устранения воспаления путем привлечения Hdac2 для специфической репрессии IL-6. Природа . (2015) 525: 389–93. DOI: 10.1038 / природа15252

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

77. Чене Ид, Басюк Е., Лин Ю.Л., Трибуле Р., Кнезевич А., Шабл-Бессия С. и др. Suv39h2 и HP1γ ответственны за опосредованное хроматином подавление транскрипции ВИЧ-1 и латентность после интеграции. EMBO J .(2007) 26: 424–35. DOI: 10.1038 / sj.emboj.7601517

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

78. Часовникарова И.А., Тиммс Р.Т., Матесон Н.Дж., Уолс К., Антробус Р., Гёттгенс Б. и др. ГЕНОВАЯ ТИШИНА. Эпигенетическое молчание с помощью комплекса HUSH опосредует изменение положения в клетках человека. Наука. (2015) 348: 1481–5. DOI: 10.1126 / science.aaa7227

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

79. Chougui G, Munir-Matloob S, Matkovic R, Martin MM, Morel M, Lahouassa H, et al.Вирусный белок X ВИЧ-2 / SIV противодействует репрессорному комплексу HUSH. Нат Микробиол . (2018) 3: 891–7. DOI: 10.1038 / s41564-018-0179-6

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

80. Юрковецкий Л., Гуней М.Х., Ким К., Го С.Л., МакКоли С., Дофин А. и др. Белки вируса иммунодефицита приматов Vpx и Vpr противодействуют репрессии транскрипции провирусов комплексом HUSH. Нат Микробиол . (2018) 3: 1354. DOI: 10.1038 / s41564-018-0256-x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

82.Хачия Р., Шиихаси Т., Сиракава И., Ивасаки Ю., Мацумура Ю., Оиси Ю. и др. Метилтрансфераза h4K9 Setdb1 регулирует TLR4-опосредованные воспалительные реакции в макрофагах. Научная репутация . (2016) 6: 28845. DOI: 10.1038 / srep28845

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

83. Xu G, Liu G, Xiong S, Liu H, Chen X, Zheng B. Гистонметилтрансфераза Smyd2 является негативным регулятором активации макрофагов, подавляя интерлейкин 6 (IL-6) и фактор некроза опухоли альфа (TNF-alpha ) производство. Дж. Биол. Хим. . (2015) 290: 5414–23. DOI: 10.1074 / jbc.M114.610345

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

84. Трибуле Р., Мари Б., Лин Ю.Л., Шабл-Бессия С., Беннассер И., Лебриганд К. и др. Подавление пути сайленсинга микроРНК ВИЧ-1 во время репликации вируса. Наука . (2007) 315: 1579–82. DOI: 10.1126 / science.1136319

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

86. Натанс Р., Чу С.Й., Серкина А.К., Лу С.К., Цао Х., Рана Т.М.Клеточная микроРНК и Р-тельца модулируют взаимодействия хозяин-ВИЧ-1. Мол Ячейки . (2009) 34: 696–709. DOI: 10.1016 / j.molcel.2009.06.003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

88. Сили Дж. Дж., Бейкер Р. Г., Мохамед Дж., Брунс Т., Хайден М. С., Дешмук С. Д. и др. Индукция врожденной иммунной памяти через нацеливание микроРНК на факторы ремоделирования хроматина. Природа . (2018) 559: 114–9. DOI: 10.1038 / s41586-018-0253-5

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

89.Кейси Клоков Л., Шарифи Х. Дж., Вен X, Флэгг М., Фуруя А. К., Некорчук М. и др. Белок Vpr ВИЧ-1 нацелен на Dicer эндорибонуклеазы для протеасомной деградации, чтобы усилить инфекцию макрофагов. Вирусология . (2013) 444: 191–202. DOI: 10.1016 / j.virol.2013.06.010

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

91. Agosto LM, Uchil PD, Mothes W. Передача ВИЧ от клетки к клетке: влияние на патогенез и антиретровирусная терапия. Trends Microbiol .(2015) 23: 289–95. DOI: 10.1016 / j.tim.2015.02.003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

92. Гуммулуру С., Пина Рамирес Н.Г., Акияма Х. CD169-зависимая клеточно-ассоциированная передача ВИЧ-1: фактор распространения вируса. J Infect Dis. (2014) 210 (Приложение 3): S641–7. DOI: 10.1093 / infdis / jiu442

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

93. Collins DR, Lubow J, Lukic Z, Mashiba M, Collins KL. Vpr способствует макрофагозависимой ВИЧ-1 инфекции CD4 + Т-лимфоцитов. PLOS Pathog . (2015) 11: e1005054. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1005054

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

94. Машиба М, Коллинз Д.Р., Терри В.Х., Коллинз К.Л. Vpr преодолевает специфическое для макрофагов ограничение экспрессии Env ВИЧ-1 и продукции вирионов. Клеточный микроб-хозяин . (2014) 16: 722–35. DOI: 10.1016 / j.chom.2014.10.014

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

95. Muthumani K, Hwang DS, Choo AY, Mayilvahanan S, Dayes NS, Thieu KP, et al.ВИЧ-1 Vpr ингибирует созревание и активацию макрофагов и дендритных клеток in vitro. Инт Иммунол . (2005) 17: 103–16. DOI: 10.1093 / intimm / dxh290

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

96. Majumder B, Janket ML, Schafer EA, Schaubert K, Huang XL, Kan-Mitchell J, et al. Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа нарушает созревание дендритных клеток и активацию Т-клеток: последствия для ускользания от вирусного иммунитета. Дж Вирол . (2005) 79: 7990–8003.DOI: 10.1128 / JVI.79.13.7990-8003.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

97. Roux P, Alfieri C, Hrimech M, Cohen EA, Tanner JE. Активация факторов транскрипции NF-κB и NF-IL-6 белком R (Vpr) вируса иммунодефицита человека 1 типа индуцирует экспрессию интерлейкина-8. Дж Вирол . (2000) 74: 4658–65. DOI: 10.1128 / JVI.74.10.4658-4665.2000

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

98. Лю Р., Линь И, Цзя Р., Гэн Ю., Лян Ц., Тан Дж и др.Vpr ВИЧ-1 стимулирует передачу сигналов NF-kappaB и AP-1, активируя TAK1. Ретровирология . (2014) 11:45. DOI: 10.1186 / 1742-4690-11-45

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

101. Акияма Х., Миллер С.М., Эттингер С.Р., Белкина А.С., Снайдер-Каппионе Дж.Э., Гуммулуру С. Экспрессия РНК, содержащей интрон ВИЧ-1, вызывает активацию врожденного иммунитета и дисфункцию Т-клеток. Нац Коммуна . (2018) 9: 3450. DOI: 10.1038 / s41467-018-05899-7

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

104.Manganaro L, Hong P, Hernandez MM, Argyle D, Mulder LCF, Potla U и др. IL-15 регулирует восприимчивость CD4 + Т-клеток к ВИЧ-инфекции. Proc Natl Acad Sci USA . (2018) 115: E9659 – E67. DOI: 10.1073 / pnas.1806695115

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

105. Окумура А., Альсе Т., Лубьева Б., Эзель Х., Штребель К., Питха П.М.. Вспомогательные белки ВИЧ-1 VPR и Vif модулируют противовирусный ответ, нацеливая IRF-3 на деградацию. Вирусология .(2008) 373: 85–97. DOI: 10.1016 / j.virol.2007.10.042

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

106. Харман А.Н., Наср Н., Фитхам А., Галоян А., Альшехри А.А., Рамбуквелле Д. и др. ВИЧ блокирует индукцию интерферона в дендритных клетках и макрофагах человека за счет нарушения регуляции TBK1. Дж Вирол . (2015) 89: 6575–84. DOI: 10.1128 / JVI.00889-15

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

107. Акияма Х., Рамирес Н.Г., Гудхети М.В., Гуммулуру С.CD169-опосредованный перенос ВИЧ в инвагинации плазматической мембраны в дендритных клетках ослабляет эффективность широко нейтрализующих антител против gp120. PLoS Патог . (2015) 11: e1004751. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1004751

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

108. Puryear WB, Akiyama H, Geer SD, Ramirez NP, Yu X, Reinhard BM, et al. Интерферон-индуцируемый механизм опосредованного дендритными клетками распространения ВИЧ-1 зависит от Siglec-1 / CD169. PLoS Патог . (2013) 9: e1003291. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1003291

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

109. Криббс С.К., Леннокс Дж., Калиендо А.М., Браун Л.А., Гуидо Д.М. Здоровые ВИЧ-1-инфицированные люди, получающие высокоактивную антиретровирусную терапию, содержат ВИЧ-1 в своих альвеолярных макрофагах. Ретровирусы AIDS Res Hum . (2015) 31: 64–70. DOI: 10.1089 / aid.2014.0133

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

110.Эстес Дж. Д., Китио С., Ссали Ф., Свейнсон Л., Макамдоп К. Н., Дель Прете Г. К. и др. Определение бремени вируса СПИДа для всего организма с последствиями для лечебных стратегий. Нат Мед . (2017) 23: 1271–6. DOI: 10,1038 / нм 4411

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

111. Honeycutt JB, Thayer WO, Baker CE, Ribeiro RM, Lada SM, Cao Y, et al. Персистенция ВИЧ в тканевых макрофагах гуманизированных мышей, содержащих только миелоиды, во время антиретровирусной терапии. Нат Мед . (2017) 23: 638–43.DOI: 10,1038 / нм 4319

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

112. Ламерс С.Л., Роуз Р., Майджи Э., Агсалда-Гарсия М., Нолан Д.Д., Фогель Г.Б. и др. ДНК ВИЧ часто присутствует в патологических тканях, оцениваемых при вскрытии, у пациентов, получавших комбинированную антиретровирусную терапию, с неопределяемой вирусной нагрузкой. Дж Вирол . (2016) 90: 8968–83. DOI: 10.1128 / JVI.00674-16

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

113.McElrath MJ, Smythe K, Randolph-Habecker J, Melton KR, Goodpaster TA, Hughes SM и др. Всесторонняя оценка клеток-мишеней ВИЧ в дистальном отделе кишечника человека предполагает повышение восприимчивости к ВИЧ в области заднего прохода. J Синдр иммунодефицита Acquir . (2013) 63: 263–71. DOI: 10.1097 / QAI.0b013e3182898392

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

114. Юкл С.А., Синклер Э., Сомсук М., Хант П.В., Эплинг Л., Киллиан М. и др. (2014). Сравнение методов измерения ректального уровня ВИЧ позволяет предположить, что ДНК ВИЧ находится в клетках, отличных от CD4 + Т-клеток, включая миелоидные клетки. СПИД . 28: 439–442. DOI: 10.1097 / QAD.0000000000000166

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

115. Арайнга М., Эдагва Б., Мосли Р.Л., Полуэктова Л.Ю., Горантла С., Гендельман Х.Э. Зрелый макрофаг является основным клеточным резервуаром ВИЧ-1 у гуманизированных мышей после лечения антиретровирусной терапией длительного действия. Ретровирология . (2017) 14:17. DOI: 10.1186 / s12977-017-0344-7

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Белок Vpr из ВИЧ-1: различные роли в жизненном цикле вируса | Ретровирология